Systémová enzymoterapie má poměrně široké uplatnění především při léčbě zánětů. Každý zánět je provázen uvolněním zánětlivých mediátorů, které jsou charakteru bílkovin. Rostlinné enzymy obsažené v přípravcích Wobenzym a Phlogenzym štěpí právě tyto bílkovinné zánetlivé mediátory. Tím je odstraněn zánět jakéhokoliv původu a posílena imunita.